1983年，林正英与前妻郑冰冰结婚，婚后育有一子林家耀（Lam Ka Yiu）和一女林式瓦（Lam Sik Ngaa）。但在五年后离婚，子女抚养权归林正英。1995年，林正英在拍摄《僵尸道长》时与苑琼丹相识。1996年，林正英与苑琼丹谱写恋曲，苑琼丹特意从跑马地迁居西贡与林正英共同生活，但后来林正英得了肝癌主动与并不知情的苑琼丹提出了分手。
因病逝世
1997年11月8日，因肝癌晚期，林正英在香港九龙圣德肋撒医院与世长辞，终年45岁。
举办葬礼
林正英生前要求办一个低调的葬礼，因此葬礼仅有他的父母、家人和朋友出席。1997年11月13日晚7点，丧礼举行了佛教仪式；出殡时，杨绍鸿、钱月笙、Ng Ming Hoi、Lam King Chu、陈会毅、钟发、洪金宝、陈永康、钱嘉乐、午马10人为其扶灵。之后，林正英的遗体被火化并在美国埋葬，而林正英生前的长袍、鞋子和帽子以及其最喜欢的衣服和太阳镜也被一同埋葬。
